Anul este 1983. Războiul Rece este în plin efect, iar umanitatea este atacată. Extratereștrii ciudați, cărora li s-a dat numele „BETA”, au coborât pe Pământ cu scopul de a distruge toată viața. Soldații au fost însărcinați să piloteze costume mari de luptă numite Tactical Surface Fighters (TSF) pentru a respinge invadatorii extratereștri, dar linia frontului este împinsă încet înapoi spre orașele supraviețuitoare.
Schwarzesmarken urmărește povestea locotenentului secund Theodor Eberbach și a celorlalți membri ai escadrilei 666 TSF, o unitate nemiloasă care prețuiește finalizarea unei misiuni asupra vieții umane. Staționată în Germania de Est și condusă de eroul de război, căpitanul Irisdina Bernhard, unitatea este specializată în atacuri de contraatac asupra clasei laser BETA. Însă escadrila 666 se găsește cu mai mulți inamici decât forțele extraterestre atunci când începătoarea optimistă Katia Waldheim se alătură escadronului, atrăgând atenția poliției secrete a Germaniei de Est, Stasi.